南通港為長江三角洲主要河港，並為國家一類開放對外貿易的口岸。憑藉水陸兩路接連長江流域的優勢，南通港成為理想之貨物中轉集散樞紐港。

作為國家其中一個重要樞紐港，南通港擁有長江岸線4.2公里，佔地1.5平方公里，共有五個主要碼頭，包括通州港、江海港、姚港港、狼山港及集裝箱碼頭。該五個碼頭合共經營24座生產泊位，其中包括2座15萬噸級泊位、5座7萬噸級泊位、4座5萬噸級泊位及3座1萬噸級泊位。南通港口集團處理之主要乾散貨種有鐵礦石、礦石、水泥熟料、鋼材、煤炭、硫磺、化肥、穀物及糧油。2010年已是南通港連續第5年成為億噸大港。

2010年，南通港口集團錄得約5,500萬噸之全年散貨吞吐量，集裝箱吞吐量達392,000標準箱，較去年分別增長0.4%及14%。