南通港为长江三角洲主要河港，并为国家一类开放对外贸易的口岸。凭借水陆两路接连长江流域的优势，南通港成为理想之货物中转集散枢纽港。

作为国家其中一个重要枢纽港，南通港拥有长江岸线4.2公里，占地1.5平方公里，共有五个主要码头，包括通州港、江海港、姚港港、狼山港及集装箱码头。该五个码头合共经营24座生产泊位，其中包括2座15万吨级泊位、5座7万吨级泊位、4座5万吨级泊位及3座1万吨级泊位。南通港口集团处理之主要干散货种有铁矿石、矿石、水泥熟料、钢材、煤炭、硫磺、化肥、谷物及粮油。2010年已是南通港连续第5年成为亿吨大港。

2010年，南通港口集团录得约5,500万吨之全年散货吞吐量，集装箱吞吐量达392,000标准箱，较去年分别增长0.4%及14%。